Jednym z największych o ile nie największym utrapieniem posiadaczy oczek wodnych są glony. Te niewielkie organizmy czekają na pierwsze promienie słońca by rozpocząć intensywny wzrost i zamienić oczko w cuchnące bajoro.
Masowy rozwój glonów ma wiele przyczyn: jakość wody, nasłonecznienie, gęstość obsady ryb, jakość pokarmu, częstotliwość karmienia, filtracja. Glony rosną bujnie gdy znajdą wszystkie potrzebne im do życia składniki: światło, dwutlenek węgla, azot, fosfor.
Możemy wpływać na te czynniki ograniczając działanie słońca przez zacienianie roślinnością lub odpowiednią lokalizację względem domu. Systematycznie usuwać materię organiczną, która gromadzi się w oczku oczywiście tam gdzie jest taka możliwość.
Złotych sposobów na glony jest wiele: lampy UV, umieszczanie w filtrach lub na dnie zbiornika w jutowych workach kwaśnego torfu, stosowanie środków chemicznych np Tropical Algin. Bactinin Pond lub Blue Guard, który nadaje wodzie niebieski kolor przez co ogranicza dopływ promieni słonecznych i tym samym rozwój glonów.
